爆発事故に巻き込まれて重傷を負った女性が、原因不明の発熱を起こす。チームを組むよう主張するカディに反発し、１人で診断に挑むハウス。患者の家で見つけた日記には、恋人が知らない事実が書き連ねられていた。やがて抗うつ剤の服用やアルコール依存症など、母親も知らない病歴が明らかになり、謎は深まるばかり。一方のウィルソンは、ハウスのギターを盗み、新しい部下を採用するよう脅しをかける。ハウスはどう対抗するのか。

宇宙飛行士を目指す女性パイロットが、視覚で音を感じる共感覚を起こす。ＮＡＳＡに知れるとプロジェクトから外されるため、極秘に診断を依頼。そこでハウスは、採用試験の一環としてチームの候補者40人に原因を探らせる。しかし患者は心臓発作を起こし、容体は悪化するばかり。検査の記録を残さずに診断は進められるのか。一方、元部下のキャメロン、チェイス、フォアマンを病院内で見かけたハウスは、自身の幻覚症状を疑う。

脊髄性筋萎縮症の男性が、車イスに乗ったまま意識を失う。採用試験を続けるハウスは部下の候補者を男女に分けて、チーム対抗戦として患者を診断させる。糞線虫症と考えて薬を処方する女性チームに対し、男性チームは手当たり次第に検査を進める。やがて患者に嚥下障害など新たな症状が。一方、外来診察に来た男性が、ハウスの目の前でナイフをコンセントに突き刺して感電する。その理由を知ったハウスは、驚くべき行動に出る。

７人に絞られたチームの候補者たちは、葬儀場で働く女性アイリーンを診断。死者の幻覚を見てけいれん大発作を起こしたことから、ハウスはＢＳＥ感染を疑い、埋葬された死体を掘り起こして検査するよう命じる。さらに病室でも別の幻覚を見るアイリーン。彼女の母親、前回死亡した車イスの患者と犬、そしてハウスの祖父の存在を口にする。一方、前職をクビになったフォアマンは採用面接を受けるが、どこの病院からも相手にされない。

肺不全で運ばれた男性が、周囲の患者と同じ症状を示す。ハウスがミラー症候群だと確信した矢先、患者が紅斑の症状を示す。患者に記憶がないため病歴も分からないまま、原因を探っていくチームの候補者たち。鏡のような患者を通して、自分たちの本来の姿と向き合う。一方、ハウスはフォアマンを復職させたカディに反発し、権力闘争と称して嫌がらせを始める。チェイスは採用試験の脱落者を巡って大規模な賭けを繰り広げる。